Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TOP3AQ13472 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
TOP3AQ13472 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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