Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
LSAMPQ13449 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50 ms