Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 AL034417.3-201ENST00000641100 1043 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 ETFRF1-205ENST00000555711 783 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 SULT1A1-211ENST00000569554 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
MKRN4PQ13434 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 LINC00226-202ENST00000618204 1052 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MKRN4PQ13434 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
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