Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRSQ13332 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRSQ13332 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRSQ13332 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRSQ13332 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRSQ13332 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PTPRSQ13332 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRSQ13332 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRSQ13332 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRSQ13332 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRSQ13332 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRSQ13332 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRSQ13332 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRSQ13332 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRSQ13332 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRSQ13332 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRSQ13332 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRSQ13332 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRSQ13332 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRSQ13332 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRSQ13332 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRSQ13332 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRSQ13332 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRSQ13332 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRSQ13332 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRSQ13332 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PTPRSQ13332 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRSQ13332 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRSQ13332 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRSQ13332 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRSQ13332 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRSQ13332 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRSQ13332 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRSQ13332 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRSQ13332 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRSQ13332 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRSQ13332 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRSQ13332 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRSQ13332 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRSQ13332 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRSQ13332 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRSQ13332 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRSQ13332 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PTPRSQ13332 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRSQ13332 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRSQ13332 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRSQ13332 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRSQ13332 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRSQ13332 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRSQ13332 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRSQ13332 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRSQ13332 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRSQ13332 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRSQ13332 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRSQ13332 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRSQ13332 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PTPRSQ13332 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRSQ13332 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRSQ13332 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRSQ13332 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRSQ13332 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRSQ13332 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRSQ13332 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PTPRSQ13332 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRSQ13332 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRSQ13332 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRSQ13332 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRSQ13332 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRSQ13332 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRSQ13332 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRSQ13332 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRSQ13332 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRSQ13332 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PTPRSQ13332 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PTPRSQ13332 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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