Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SLAMF1Q13291 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
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