Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PTGDRQ13258 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PTGDRQ13258 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
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