Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
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ERCC8Q13216 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERCC8Q13216 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERCC8Q13216 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERCC8Q13216 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ERCC8Q13216 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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ERCC8Q13216 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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ERCC8Q13216 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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ERCC8Q13216 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ERCC8Q13216 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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ERCC8Q13216 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERCC8Q13216 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ERCC8Q13216 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
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