Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

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Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA3BQ13214 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA3BQ13214 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA3BQ13214 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA3BQ13214 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA3BQ13214 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SEMA3BQ13214 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SEMA3BQ13214 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SEMA3BQ13214 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SEMA3BQ13214 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SEMA3BQ13214 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SEMA3BQ13214 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SEMA3BQ13214 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SEMA3BQ13214 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SEMA3BQ13214 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SEMA3BQ13214 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
SEMA3BQ13214 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
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SEMA3BQ13214 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
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SEMA3BQ13214 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SEMA3BQ13214 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
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SEMA3BQ13214 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SEMA3BQ13214 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SEMA3BQ13214 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SEMA3BQ13214 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SEMA3BQ13214 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SEMA3BQ13214 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SEMA3BQ13214 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SEMA3BQ13214 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SEMA3BQ13214 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SEMA3BQ13214 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
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SEMA3BQ13214 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SEMA3BQ13214 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SEMA3BQ13214 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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SEMA3BQ13214 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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SEMA3BQ13214 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
SEMA3BQ13214 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
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SEMA3BQ13214 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SEMA3BQ13214 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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SEMA3BQ13214 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SEMA3BQ13214 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
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SEMA3BQ13214 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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SEMA3BQ13214 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SEMA3BQ13214 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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SEMA3BQ13214 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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SEMA3BQ13214 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SEMA3BQ13214 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
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SEMA3BQ13214 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SEMA3BQ13214 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SEMA3BQ13214 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SEMA3BQ13214 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SEMA3BQ13214 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SEMA3BQ13214 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SEMA3BQ13214 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SEMA3BQ13214 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SEMA3BQ13214 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SEMA3BQ13214 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SEMA3BQ13214 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SEMA3BQ13214 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SEMA3BQ13214 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SEMA3BQ13214 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SEMA3BQ13214 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SEMA3BQ13214 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
SEMA3BQ13214 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SEMA3BQ13214 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SEMA3BQ13214 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SEMA3BQ13214 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SEMA3BQ13214 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
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