Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RLFQ13129 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RLFQ13129 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RLFQ13129 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RLFQ13129 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RLFQ13129 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RLFQ13129 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RLFQ13129 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RLFQ13129 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RLFQ13129 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RLFQ13129 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RLFQ13129 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RLFQ13129 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RLFQ13129 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RLFQ13129 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RLFQ13129 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RLFQ13129 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RLFQ13129 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RLFQ13129 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RLFQ13129 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RLFQ13129 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RLFQ13129 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RLFQ13129 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RLFQ13129 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RLFQ13129 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RLFQ13129 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RLFQ13129 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RLFQ13129 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RLFQ13129 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RLFQ13129 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RLFQ13129 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RLFQ13129 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RLFQ13129 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RLFQ13129 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RLFQ13129 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RLFQ13129 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RLFQ13129 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RLFQ13129 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RLFQ13129 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RLFQ13129 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RLFQ13129 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RLFQ13129 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RLFQ13129 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RLFQ13129 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RLFQ13129 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RLFQ13129 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RLFQ13129 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RLFQ13129 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RLFQ13129 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RLFQ13129 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RLFQ13129 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RLFQ13129 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RLFQ13129 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RLFQ13129 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
RLFQ13129 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RLFQ13129 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RLFQ13129 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RLFQ13129 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RLFQ13129 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RLFQ13129 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RLFQ13129 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RLFQ13129 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RLFQ13129 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RLFQ13129 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RLFQ13129 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RLFQ13129 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RLFQ13129 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RLFQ13129 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RLFQ13129 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RLFQ13129 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RLFQ13129 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RLFQ13129 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RLFQ13129 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RLFQ13129 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RLFQ13129 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RLFQ13129 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RLFQ13129 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RLFQ13129 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RLFQ13129 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RLFQ13129 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RLFQ13129 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RLFQ13129 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RLFQ13129 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RLFQ13129 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RLFQ13129 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RLFQ13129 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RLFQ13129 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RLFQ13129 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RLFQ13129 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RLFQ13129 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RLFQ13129 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RLFQ13129 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RLFQ13129 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RLFQ13129 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RLFQ13129 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RLFQ13129 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
RLFQ13129 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RLFQ13129 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RLFQ13129 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RLFQ13129 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms