Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
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