Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
GRIN2AQ12879 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.82
GRIN2AQ12879 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
GRIN2AQ12879 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
GRIN2AQ12879 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
GRIN2AQ12879 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
GRIN2AQ12879 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC32.68■■■□□ 2.82
GRIN2AQ12879 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
GRIN2AQ12879 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
GRIN2AQ12879 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
GRIN2AQ12879 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
GRIN2AQ12879 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
GRIN2AQ12879 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
GRIN2AQ12879 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
GRIN2AQ12879 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
GRIN2AQ12879 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
GRIN2AQ12879 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
GRIN2AQ12879 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
GRIN2AQ12879 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
GRIN2AQ12879 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
GRIN2AQ12879 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
GRIN2AQ12879 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
GRIN2AQ12879 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
GRIN2AQ12879 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
GRIN2AQ12879 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
GRIN2AQ12879 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
GRIN2AQ12879 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
GRIN2AQ12879 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
GRIN2AQ12879 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
GRIN2AQ12879 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
GRIN2AQ12879 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
GRIN2AQ12879 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
GRIN2AQ12879 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
GRIN2AQ12879 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.67■■■□□ 2.82
GRIN2AQ12879 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
GRIN2AQ12879 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
GRIN2AQ12879 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
GRIN2AQ12879 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
GRIN2AQ12879 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC32.66■■■□□ 2.82
GRIN2AQ12879 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
GRIN2AQ12879 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
GRIN2AQ12879 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
GRIN2AQ12879 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
GRIN2AQ12879 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
GRIN2AQ12879 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
GRIN2AQ12879 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.66■■■□□ 2.82
GRIN2AQ12879 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
GRIN2AQ12879 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
GRIN2AQ12879 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
GRIN2AQ12879 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
GRIN2AQ12879 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
GRIN2AQ12879 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
GRIN2AQ12879 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
GRIN2AQ12879 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
GRIN2AQ12879 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
GRIN2AQ12879 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
GRIN2AQ12879 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
GRIN2AQ12879 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
GRIN2AQ12879 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
GRIN2AQ12879 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
GRIN2AQ12879 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
GRIN2AQ12879 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
GRIN2AQ12879 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
GRIN2AQ12879 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
GRIN2AQ12879 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
GRIN2AQ12879 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
GRIN2AQ12879 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
GRIN2AQ12879 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
GRIN2AQ12879 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
GRIN2AQ12879 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
GRIN2AQ12879 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC32.63■■■□□ 2.81
GRIN2AQ12879 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
GRIN2AQ12879 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
GRIN2AQ12879 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
GRIN2AQ12879 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
GRIN2AQ12879 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
GRIN2AQ12879 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
GRIN2AQ12879 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
GRIN2AQ12879 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
GRIN2AQ12879 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
GRIN2AQ12879 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
GRIN2AQ12879 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
GRIN2AQ12879 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC32.62■■■□□ 2.81
GRIN2AQ12879 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
GRIN2AQ12879 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
GRIN2AQ12879 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
GRIN2AQ12879 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC32.61■■■□□ 2.81
GRIN2AQ12879 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC32.61■■■□□ 2.81
GRIN2AQ12879 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
GRIN2AQ12879 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
GRIN2AQ12879 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
GRIN2AQ12879 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
GRIN2AQ12879 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
GRIN2AQ12879 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC32.61■■■□□ 2.81
GRIN2AQ12879 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
GRIN2AQ12879 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
GRIN2AQ12879 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
GRIN2AQ12879 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
GRIN2AQ12879 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
GRIN2AQ12879 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
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