Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
SMARCB1Q12824 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
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