Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
KCNMA1Q12791 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNMA1Q12791 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNMA1Q12791 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNMA1Q12791 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNMA1Q12791 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNMA1Q12791 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNMA1Q12791 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNMA1Q12791 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNMA1Q12791 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNMA1Q12791 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNMA1Q12791 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNMA1Q12791 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNMA1Q12791 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNMA1Q12791 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNMA1Q12791 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNMA1Q12791 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
KCNMA1Q12791 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNMA1Q12791 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNMA1Q12791 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNMA1Q12791 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNMA1Q12791 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNMA1Q12791 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNMA1Q12791 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNMA1Q12791 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNMA1Q12791 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNMA1Q12791 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNMA1Q12791 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNMA1Q12791 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNMA1Q12791 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNMA1Q12791 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNMA1Q12791 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNMA1Q12791 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNMA1Q12791 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNMA1Q12791 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNMA1Q12791 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
KCNMA1Q12791 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNMA1Q12791 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNMA1Q12791 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNMA1Q12791 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNMA1Q12791 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNMA1Q12791 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNMA1Q12791 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNMA1Q12791 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNMA1Q12791 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
KCNMA1Q12791 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
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