Protein–RNA interactions for Protein: Q12373

HIF1, HAT1-interacting factor 1, yeastyeast

Predictions only

Length 385 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HIF1Q12373 BIL1YOR304C-A 231 nt1.2□□□□□ -2.22
HIF1Q12373 YPR197CYPR197C 564 nt1.2□□□□□ -2.22
HIF1Q12373 EAF1YDR359C 2949 nt1.2□□□□□ -2.22
HIF1Q12373 YDR426CYDR426C 378 nt1.19□□□□□ -2.22
HIF1Q12373 YMR242W-AYMR242W-A 90 nt1.19□□□□□ -2.22
HIF1Q12373 ZIP2YGL249W 2115 nt1.19□□□□□ -2.22
HIF1Q12373 SCC2YDR180W 4482 nt1.19□□□□□ -2.22
HIF1Q12373 SCW11YGL028C 1629 nt1.18□□□□□ -2.22
HIF1Q12373 INP2YMR163C 2118 nt1.18□□□□□ -2.22
HIF1Q12373 RPL35AYDL191W 363 nt1.18□□□□□ -2.22
HIF1Q12373 IFH1YLR223C 3258 nt1.18□□□□□ -2.22
HIF1Q12373 UBP3YER151C 2739 nt1.18□□□□□ -2.22
HIF1Q12373 NUT1YGL151W 3399 nt1.17□□□□□ -2.22
HIF1Q12373 YML007C-AYML007C-A 111 nt1.17□□□□□ -2.22
HIF1Q12373 YAF9YNL107W 681 nt1.17□□□□□ -2.22
HIF1Q12373 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt1.17□□□□□ -2.22
HIF1Q12373 NOC3YLR002C 1992 nt1.17□□□□□ -2.22
HIF1Q12373 SPT21YMR179W 2277 nt1.17□□□□□ -2.22
HIF1Q12373 STB6YKL072W 2301 nt1.16□□□□□ -2.22
HIF1Q12373 NPC2YDL046W 522 nt1.16□□□□□ -2.22
HIF1Q12373 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt1.15□□□□□ -2.23
HIF1Q12373 YOL160WYOL160W 342 nt1.15□□□□□ -2.23
HIF1Q12373 YPL225WYPL225W 441 nt1.15□□□□□ -2.23
HIF1Q12373 RPL38YLR325C 237 nt1.14□□□□□ -2.23
HIF1Q12373 APL3YBL037W 3078 nt1.14□□□□□ -2.23
HIF1Q12373 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt1.13□□□□□ -2.23
HIF1Q12373 DOP1YDR141C 5097 nt1.12□□□□□ -2.23
HIF1Q12373 YDR048CYDR048C 315 nt1.12□□□□□ -2.23
HIF1Q12373 YAR029WYAR029W 225 nt1.12□□□□□ -2.23
HIF1Q12373 HTB2YBL002W 396 nt1.12□□□□□ -2.23
HIF1Q12373 RPS30BYOR182C 192 nt1.12□□□□□ -2.23
HIF1Q12373 RIM20YOR275C 1986 nt1.12□□□□□ -2.23
HIF1Q12373 LCD1YDR499W 2244 nt1.11□□□□□ -2.23
HIF1Q12373 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt1.11□□□□□ -2.23
HIF1Q12373 MAM33YIL070C 801 nt1.11□□□□□ -2.23
HIF1Q12373 PCC1YKR095W-A 267 nt1.11□□□□□ -2.23
HIF1Q12373 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt1.11□□□□□ -2.23
HIF1Q12373 RAD34YDR314C 2079 nt1.11□□□□□ -2.23
HIF1Q12373 PAM16YJL104W 450 nt1.1□□□□□ -2.23
HIF1Q12373 MPT5YGL178W 2580 nt1.1□□□□□ -2.23
HIF1Q12373 FIG4YNL325C 2640 nt1.1□□□□□ -2.23
HIF1Q12373 SLI15YBR156C 2097 nt1.09□□□□□ -2.23
HIF1Q12373 SET3YKR029C 2256 nt1.09□□□□□ -2.23
HIF1Q12373 YDR102CYDR102C 333 nt1.09□□□□□ -2.23
HIF1Q12373 YJR011CYJR011C 786 nt1.09□□□□□ -2.23
HIF1Q12373 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt1.09□□□□□ -2.23
HIF1Q12373 GEA2YEL022W 4380 nt1.08□□□□□ -2.24
HIF1Q12373 YDR524W-CYDR524W-C 90 nt1.08□□□□□ -2.24
HIF1Q12373 YPL038W-AYPL038W-A 192 nt1.08□□□□□ -2.24
HIF1Q12373 STO1YMR125W 2586 nt1.08□□□□□ -2.24
HIF1Q12373 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt1.07□□□□□ -2.24
HIF1Q12373 PKH2YOL100W 3246 nt1.07□□□□□ -2.24
HIF1Q12373 BEM2YER155C 6504 nt1.06□□□□□ -2.24
HIF1Q12373 NHP2YDL208W 471 nt1.06□□□□□ -2.24
HIF1Q12373 NIP100YPL174C 2607 nt1.06□□□□□ -2.24
HIF1Q12373 INA22YIR024C 651 nt1.05□□□□□ -2.24
HIF1Q12373 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt1.05□□□□□ -2.24
HIF1Q12373 snR36snR36 182 nt1.05□□□□□ -2.24
HIF1Q12373 AIM44YPL158C 2277 nt1.04□□□□□ -2.24
HIF1Q12373 SSS1YDR086C 243 nt1.04□□□□□ -2.24
HIF1Q12373 TAR1YLR154W-C 375 nt1.04□□□□□ -2.24
HIF1Q12373 YBR206WYBR206W 324 nt1.04□□□□□ -2.24
HIF1Q12373 YDL206WYDL206W 2289 nt1.04□□□□□ -2.24
HIF1Q12373 YCK3YER123W 1575 nt1.04□□□□□ -2.24
HIF1Q12373 NUP157YER105C 4176 nt1.04□□□□□ -2.24
HIF1Q12373 YPR117WYPR117W 7470 nt1.03□□□□□ -2.25
HIF1Q12373 YFL032WYFL032W 321 nt1.02□□□□□ -2.25
HIF1Q12373 RKR1YMR247C 4689 nt1.02□□□□□ -2.25
HIF1Q12373 DBP6YNR038W 1890 nt1.02□□□□□ -2.25
HIF1Q12373 SMC1YFL008W 3678 nt1.01□□□□□ -2.25
HIF1Q12373 GPG1YGL121C 381 nt1.01□□□□□ -2.25
HIF1Q12373 YBR064WYBR064W 429 nt1.01□□□□□ -2.25
HIF1Q12373 CUL3YGR003W 2235 nt1.01□□□□□ -2.25
HIF1Q12373 MMS4YBR098W 2076 nt1.01□□□□□ -2.25
HIF1Q12373 YLL007CYLL007C 1998 nt1□□□□□ -2.25
HIF1Q12373 YDR413CYDR413C 576 nt1□□□□□ -2.25
HIF1Q12373 Q0142Q0142 177 nt1□□□□□ -2.25
HIF1Q12373 OST1YJL002C 1431 nt0.99□□□□□ -2.25
HIF1Q12373 UTP20YBL004W 7482 nt0.99□□□□□ -2.25
HIF1Q12373 ECM12YHR021W-A 456 nt0.99□□□□□ -2.25
HIF1Q12373 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt0.99□□□□□ -2.25
HIF1Q12373 YKL118WYKL118W 312 nt0.99□□□□□ -2.25
HIF1Q12373 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt0.99□□□□□ -2.25
HIF1Q12373 YDR521WYDR521W 336 nt0.98□□□□□ -2.25
HIF1Q12373 PDE2YOR360C 1581 nt0.98□□□□□ -2.25
HIF1Q12373 snR60snR60 104 nt0.97□□□□□ -2.25
HIF1Q12373 PAU12YGR294W 363 nt0.97□□□□□ -2.25
HIF1Q12373 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt0.97□□□□□ -2.25
HIF1Q12373 PAU24YBR301W 363 nt0.97□□□□□ -2.25
HIF1Q12373 WAR1YML076C 2835 nt0.96□□□□□ -2.26
HIF1Q12373 YER097WYER097W 330 nt0.96□□□□□ -2.26
HIF1Q12373 YKL136WYKL136W 399 nt0.96□□□□□ -2.26
HIF1Q12373 ALY2YJL084C 3141 nt0.96□□□□□ -2.26
HIF1Q12373 YDR344CYDR344C 444 nt0.95□□□□□ -2.26
HIF1Q12373 YIR044CYIR044C 186 nt0.95□□□□□ -2.26
HIF1Q12373 MCM10YIL150C 1716 nt0.95□□□□□ -2.26
HIF1Q12373 SPO21YOL091W 1830 nt0.94□□□□□ -2.26
HIF1Q12373 PTP2YOR208W 2253 nt0.94□□□□□ -2.26
HIF1Q12373 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt0.94□□□□□ -2.26
HIF1Q12373 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.94□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 18.1 ms