Protein–RNA interactions for Protein: Q12215

WSC3, Cell wall integrity and stress response component 3, yeastyeast

Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
WSC3Q12215 SIZ1YDR409W 2715 nt3.19□□□□□ -1.9
WSC3Q12215 tD(GUC)QtD(GUC)Q 75 nt3.19□□□□□ -1.9
WSC3Q12215 PIK1YNL267W 3201 nt3.19□□□□□ -1.9
WSC3Q12215 ISW1YBR245C 3390 nt3.18□□□□□ -1.9
WSC3Q12215 SEC26YDR238C 2922 nt3.18□□□□□ -1.9
WSC3Q12215 MBB1YJL199C 327 nt3.18□□□□□ -1.9
WSC3Q12215 RPB2YOR151C 3675 nt3.18□□□□□ -1.9
WSC3Q12215 NNF2YGR089W 2811 nt3.17□□□□□ -1.9
WSC3Q12215 VPS8YAL002W 3825 nt3.17□□□□□ -1.9
WSC3Q12215 EST1YLR233C 2100 nt3.17□□□□□ -1.9
WSC3Q12215 NUP157YER105C 4176 nt3.17□□□□□ -1.9
WSC3Q12215 YHR180C-BYHR180C-B 105 nt3.16□□□□□ -1.9
WSC3Q12215 TUS1YLR425W 3924 nt3.15□□□□□ -1.9
WSC3Q12215 SDC25YLL016W 3147 nt3.15□□□□□ -1.9
WSC3Q12215 URA2YJL130C 6645 nt3.15□□□□□ -1.91
WSC3Q12215 SWH1YAR042W 3567 nt3.15□□□□□ -1.91
WSC3Q12215 SWI1YPL016W 3945 nt3.14□□□□□ -1.91
WSC3Q12215 BUD2YKL092C 3315 nt3.14□□□□□ -1.91
WSC3Q12215 RPL26BYGR034W 384 nt3.14□□□□□ -1.91
WSC3Q12215 COA6YMR244C-A 315 nt3.14□□□□□ -1.91
WSC3Q12215 STU1YBL034C 4542 nt3.14□□□□□ -1.91
WSC3Q12215 YOR376W-AYOR376W-A 156 nt3.12□□□□□ -1.91
WSC3Q12215 RAD26YJR035W 3258 nt3.12□□□□□ -1.91
WSC3Q12215 YHR080CYHR080C 4038 nt3.11□□□□□ -1.91
WSC3Q12215 SWR1YDR334W 4545 nt3.11□□□□□ -1.91
WSC3Q12215 SPT6YGR116W 4356 nt3.11□□□□□ -1.91
WSC3Q12215 SAC3YDR159W 3906 nt3.11□□□□□ -1.91
WSC3Q12215 DAN4YJR151C 3486 nt3.1□□□□□ -1.91
WSC3Q12215 YML054C-AYML054C-A 159 nt3.1□□□□□ -1.91
WSC3Q12215 TSC11YER093C 4293 nt3.1□□□□□ -1.91
WSC3Q12215 TRS130YMR218C 3309 nt3.1□□□□□ -1.91
WSC3Q12215 UFD4YKL010C 4452 nt3.1□□□□□ -1.91
WSC3Q12215 RAX2YLR084C 3663 nt3.09□□□□□ -1.91
WSC3Q12215 CHS1YNL192W 3396 nt3.09□□□□□ -1.91
WSC3Q12215 GCN2YDR283C 4980 nt3.09□□□□□ -1.91
WSC3Q12215 SEY1YOR165W 2331 nt3.09□□□□□ -1.91
WSC3Q12215 YDR464C-AYDR464C-A 189 nt3.09□□□□□ -1.91
WSC3Q12215 ANS1YHR126C 480 nt3.09□□□□□ -1.91
WSC3Q12215 NCR1YPL006W 3513 nt3.09□□□□□ -1.91
WSC3Q12215 SIP4YJL089W 2490 nt3.09□□□□□ -1.92
WSC3Q12215 SPO71YDR104C 3738 nt3.08□□□□□ -1.92
WSC3Q12215 YDL159C-BYDL159C-B 177 nt3.08□□□□□ -1.92
WSC3Q12215 tC(GCA)BtC(GCA)B 72 nt3.08□□□□□ -1.92
WSC3Q12215 tC(GCA)GtC(GCA)G 72 nt3.08□□□□□ -1.92
WSC3Q12215 tC(GCA)P1tC(GCA)P1 72 nt3.08□□□□□ -1.92
WSC3Q12215 tC(GCA)P2tC(GCA)P2 72 nt3.08□□□□□ -1.92
WSC3Q12215 RGR1YLR071C 3249 nt3.08□□□□□ -1.92
WSC3Q12215 MRD1YPR112C 2664 nt3.07□□□□□ -1.92
WSC3Q12215 JSN1YJR091C 3276 nt3.07□□□□□ -1.92
WSC3Q12215 RRP5YMR229C 5190 nt3.07□□□□□ -1.92
WSC3Q12215 SPC110YDR356W 2835 nt3.06□□□□□ -1.92
WSC3Q12215 YER172C-AYER172C-A 381 nt3.06□□□□□ -1.92
WSC3Q12215 BUB1YGR188C 3066 nt3.06□□□□□ -1.92
WSC3Q12215 OSH3YHR073W 2991 nt3.06□□□□□ -1.92
WSC3Q12215 RPS28BYLR264W 204 nt3.05□□□□□ -1.92
WSC3Q12215 DSE4YNR067C 3354 nt3.05□□□□□ -1.92
WSC3Q12215 MDN1YLR106C 14733 nt3.05□□□□□ -1.92
WSC3Q12215 ROM1YGR070W 3468 nt3.03□□□□□ -1.92
WSC3Q12215 BPT1YLL015W 4680 nt3.03□□□□□ -1.92
WSC3Q12215 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt3.03□□□□□ -1.92
WSC3Q12215 SLA1YBL007C 3735 nt3.03□□□□□ -1.93
WSC3Q12215 APE2YKL157W 2859 nt3.02□□□□□ -1.93
WSC3Q12215 FLO5YHR211W 3228 nt3.02□□□□□ -1.93
WSC3Q12215 SMC3YJL074C 3693 nt3.02□□□□□ -1.93
WSC3Q12215 PAU10YDR542W 363 nt3.02□□□□□ -1.93
WSC3Q12215 PAU4YLR461W 363 nt3.02□□□□□ -1.93
WSC3Q12215 ENA5YDR038C 3276 nt3.01□□□□□ -1.93
WSC3Q12215 ENA2YDR039C 3276 nt3.01□□□□□ -1.93
WSC3Q12215 ENA1YDR040C 3276 nt3.01□□□□□ -1.93
WSC3Q12215 SIN3YOL004W 4611 nt3.01□□□□□ -1.93
WSC3Q12215 YIL082W-AYIL082W-A 4497 nt3.01□□□□□ -1.93
WSC3Q12215 PKH3YDR466W 2697 nt3.01□□□□□ -1.93
WSC3Q12215 PAN2YGL094C 3348 nt3□□□□□ -1.93
WSC3Q12215 AGC1YPR021C 2709 nt3□□□□□ -1.93
WSC3Q12215 NST1YNL091W 3723 nt2.99□□□□□ -1.93
WSC3Q12215 AKR1YDR264C 2295 nt2.99□□□□□ -1.93
WSC3Q12215 SPA2YLL021W 4401 nt2.99□□□□□ -1.93
WSC3Q12215 RPA190YOR341W 4995 nt2.99□□□□□ -1.93
WSC3Q12215 RPS21AYKR057W 264 nt2.99□□□□□ -1.93
WSC3Q12215 CBF2YGR140W 2871 nt2.98□□□□□ -1.93
WSC3Q12215 MET5YJR137C 4329 nt2.98□□□□□ -1.93
WSC3Q12215 TRL1YJL087C 2484 nt2.98□□□□□ -1.93
WSC3Q12215 EST2YLR318W 2655 nt2.97□□□□□ -1.93
WSC3Q12215 BEM3YPL115C 3387 nt2.97□□□□□ -1.93
WSC3Q12215 YPL060C-AYPL060C-A 3315 nt2.97□□□□□ -1.93
WSC3Q12215 NAB6YML117W 3405 nt2.96□□□□□ -1.94
WSC3Q12215 YOR055WYOR055W 435 nt2.95□□□□□ -1.94
WSC3Q12215 INP51YIL002C 2841 nt2.94□□□□□ -1.94
WSC3Q12215 YDR209CYDR209C 414 nt2.93□□□□□ -1.94
WSC3Q12215 RDS3YPR094W 324 nt2.92□□□□□ -1.94
WSC3Q12215 RPA135YPR010C 3612 nt2.92□□□□□ -1.94
WSC3Q12215 POL3YDL102W 3294 nt2.91□□□□□ -1.94
WSC3Q12215 YMR122W-AYMR122W-A 255 nt2.91□□□□□ -1.94
WSC3Q12215 snR14snR14 160 nt2.91□□□□□ -1.94
WSC3Q12215 PDR1YGL013C 3207 nt2.91□□□□□ -1.94
WSC3Q12215 VAS1YGR094W 3315 nt2.91□□□□□ -1.94
WSC3Q12215 SMC6YLR383W 3345 nt2.9□□□□□ -1.94
WSC3Q12215 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt2.9□□□□□ -1.95
WSC3Q12215 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt2.9□□□□□ -1.95
WSC3Q12215 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt2.9□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 70.6 ms