Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
AP1B1Q10567 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
AP1B1Q10567 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
AP1B1Q10567 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
AP1B1Q10567 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
AP1B1Q10567 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
AP1B1Q10567 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
AP1B1Q10567 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
AP1B1Q10567 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
AP1B1Q10567 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
AP1B1Q10567 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
AP1B1Q10567 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
AP1B1Q10567 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
AP1B1Q10567 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
AP1B1Q10567 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
AP1B1Q10567 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
AP1B1Q10567 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
AP1B1Q10567 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
AP1B1Q10567 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
AP1B1Q10567 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
AP1B1Q10567 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
AP1B1Q10567 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
AP1B1Q10567 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
AP1B1Q10567 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
AP1B1Q10567 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
AP1B1Q10567 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
AP1B1Q10567 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
AP1B1Q10567 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
AP1B1Q10567 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
AP1B1Q10567 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
AP1B1Q10567 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
AP1B1Q10567 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
AP1B1Q10567 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
AP1B1Q10567 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
AP1B1Q10567 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
AP1B1Q10567 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.71■□□□□ 0.91
AP1B1Q10567 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
AP1B1Q10567 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
AP1B1Q10567 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
AP1B1Q10567 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
AP1B1Q10567 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
AP1B1Q10567 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
AP1B1Q10567 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
AP1B1Q10567 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
AP1B1Q10567 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
AP1B1Q10567 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
AP1B1Q10567 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
AP1B1Q10567 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
AP1B1Q10567 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
AP1B1Q10567 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
AP1B1Q10567 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
AP1B1Q10567 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
AP1B1Q10567 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
AP1B1Q10567 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
AP1B1Q10567 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
AP1B1Q10567 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
AP1B1Q10567 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
AP1B1Q10567 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
AP1B1Q10567 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
AP1B1Q10567 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
AP1B1Q10567 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
AP1B1Q10567 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
AP1B1Q10567 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
AP1B1Q10567 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
AP1B1Q10567 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
AP1B1Q10567 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
AP1B1Q10567 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
AP1B1Q10567 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
AP1B1Q10567 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
AP1B1Q10567 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
AP1B1Q10567 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
AP1B1Q10567 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
AP1B1Q10567 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
AP1B1Q10567 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
AP1B1Q10567 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
AP1B1Q10567 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
AP1B1Q10567 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
AP1B1Q10567 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
AP1B1Q10567 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
AP1B1Q10567 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
AP1B1Q10567 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
AP1B1Q10567 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
AP1B1Q10567 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
AP1B1Q10567 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
AP1B1Q10567 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
AP1B1Q10567 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
AP1B1Q10567 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
AP1B1Q10567 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
AP1B1Q10567 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
AP1B1Q10567 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
AP1B1Q10567 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
AP1B1Q10567 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
AP1B1Q10567 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
AP1B1Q10567 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
AP1B1Q10567 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
AP1B1Q10567 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
AP1B1Q10567 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
AP1B1Q10567 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
AP1B1Q10567 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
AP1B1Q10567 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms