Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAK6

LMOD3, Leiomodin-3, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD3Q0VAK6 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMOD3Q0VAK6 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMOD3Q0VAK6 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMOD3Q0VAK6 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
LMOD3Q0VAK6 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMOD3Q0VAK6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMOD3Q0VAK6 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
LMOD3Q0VAK6 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMOD3Q0VAK6 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMOD3Q0VAK6 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
LMOD3Q0VAK6 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMOD3Q0VAK6 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMOD3Q0VAK6 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
LMOD3Q0VAK6 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMOD3Q0VAK6 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMOD3Q0VAK6 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMOD3Q0VAK6 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMOD3Q0VAK6 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMOD3Q0VAK6 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMOD3Q0VAK6 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMOD3Q0VAK6 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMOD3Q0VAK6 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMOD3Q0VAK6 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMOD3Q0VAK6 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMOD3Q0VAK6 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMOD3Q0VAK6 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
LMOD3Q0VAK6 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
LMOD3Q0VAK6 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LMOD3Q0VAK6 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LMOD3Q0VAK6 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LMOD3Q0VAK6 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LMOD3Q0VAK6 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LMOD3Q0VAK6 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LMOD3Q0VAK6 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LMOD3Q0VAK6 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LMOD3Q0VAK6 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LMOD3Q0VAK6 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
LMOD3Q0VAK6 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LMOD3Q0VAK6 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
LMOD3Q0VAK6 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LMOD3Q0VAK6 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LMOD3Q0VAK6 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LMOD3Q0VAK6 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LMOD3Q0VAK6 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
LMOD3Q0VAK6 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMOD3Q0VAK6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMOD3Q0VAK6 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMOD3Q0VAK6 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMOD3Q0VAK6 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMOD3Q0VAK6 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMOD3Q0VAK6 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMOD3Q0VAK6 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMOD3Q0VAK6 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
LMOD3Q0VAK6 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMOD3Q0VAK6 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMOD3Q0VAK6 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMOD3Q0VAK6 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMOD3Q0VAK6 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
LMOD3Q0VAK6 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMOD3Q0VAK6 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMOD3Q0VAK6 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMOD3Q0VAK6 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMOD3Q0VAK6 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMOD3Q0VAK6 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMOD3Q0VAK6 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
LMOD3Q0VAK6 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LMOD3Q0VAK6 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LMOD3Q0VAK6 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LMOD3Q0VAK6 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LMOD3Q0VAK6 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
LMOD3Q0VAK6 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
LMOD3Q0VAK6 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LMOD3Q0VAK6 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
LMOD3Q0VAK6 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LMOD3Q0VAK6 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LMOD3Q0VAK6 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LMOD3Q0VAK6 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LMOD3Q0VAK6 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LMOD3Q0VAK6 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.77
LMOD3Q0VAK6 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LMOD3Q0VAK6 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LMOD3Q0VAK6 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
LMOD3Q0VAK6 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LMOD3Q0VAK6 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
LMOD3Q0VAK6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMOD3Q0VAK6 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMOD3Q0VAK6 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMOD3Q0VAK6 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMOD3Q0VAK6 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMOD3Q0VAK6 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
LMOD3Q0VAK6 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMOD3Q0VAK6 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMOD3Q0VAK6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMOD3Q0VAK6 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMOD3Q0VAK6 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMOD3Q0VAK6 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMOD3Q0VAK6 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMOD3Q0VAK6 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMOD3Q0VAK6 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMOD3Q0VAK6 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms