Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
IFFO1Q0D2I5 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms