Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PAX8Q06710 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
PAX8Q06710 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms