Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.92■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
EXOSC9Q06265 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
EXOSC9Q06265 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms