Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CALD1Q05682 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CALD1Q05682 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CALD1Q05682 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CALD1Q05682 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CALD1Q05682 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CALD1Q05682 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CALD1Q05682 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CALD1Q05682 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CALD1Q05682 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CALD1Q05682 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CALD1Q05682 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CALD1Q05682 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CALD1Q05682 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CALD1Q05682 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CALD1Q05682 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CALD1Q05682 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CALD1Q05682 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CALD1Q05682 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CALD1Q05682 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CALD1Q05682 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CALD1Q05682 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CALD1Q05682 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CALD1Q05682 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CALD1Q05682 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CALD1Q05682 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CALD1Q05682 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CALD1Q05682 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CALD1Q05682 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CALD1Q05682 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CALD1Q05682 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CALD1Q05682 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms