Protein–RNA interactions for Protein: Q05027

TAF9, Transcription initiation factor TFIID subunit 9, yeastyeast

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Length 157 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TAF9Q05027 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt0.78□□□□□ -2.28
TAF9Q05027 YPL205CYPL205C 345 nt0.78□□□□□ -2.28
TAF9Q05027 PKH2YOL100W 3246 nt0.78□□□□□ -2.28
TAF9Q05027 ATG31YDR022C 591 nt0.77□□□□□ -2.29
TAF9Q05027 YLR434CYLR434C 384 nt0.76□□□□□ -2.29
TAF9Q05027 CMC4YMR194C-B 222 nt0.76□□□□□ -2.29
TAF9Q05027 YPL068CYPL068C 882 nt0.76□□□□□ -2.29
TAF9Q05027 YPL185WYPL185W 396 nt0.76□□□□□ -2.29
TAF9Q05027 RPS20YHL015W 366 nt0.75□□□□□ -2.29
TAF9Q05027 YHL042WYHL042W 453 nt0.75□□□□□ -2.29
TAF9Q05027 tT(AGU)BtT(AGU)B 73 nt0.75□□□□□ -2.29
TAF9Q05027 tT(AGU)CtT(AGU)C 73 nt0.75□□□□□ -2.29
TAF9Q05027 tT(AGU)DtT(AGU)D 73 nt0.75□□□□□ -2.29
TAF9Q05027 tT(AGU)HtT(AGU)H 73 nt0.75□□□□□ -2.29
TAF9Q05027 tT(AGU)I1tT(AGU)I1 73 nt0.75□□□□□ -2.29
TAF9Q05027 tT(AGU)I2tT(AGU)I2 73 nt0.75□□□□□ -2.29
TAF9Q05027 tT(AGU)JtT(AGU)J 73 nt0.75□□□□□ -2.29
TAF9Q05027 tT(AGU)N1tT(AGU)N1 73 nt0.75□□□□□ -2.29
TAF9Q05027 tT(AGU)N2tT(AGU)N2 73 nt0.75□□□□□ -2.29
TAF9Q05027 tT(AGU)O1tT(AGU)O1 73 nt0.75□□□□□ -2.29
TAF9Q05027 tT(AGU)O2tT(AGU)O2 73 nt0.75□□□□□ -2.29
TAF9Q05027 YKL063CYKL063C 504 nt0.75□□□□□ -2.29
TAF9Q05027 NIP100YPL174C 2607 nt0.75□□□□□ -2.29
TAF9Q05027 RKR1YMR247C 4689 nt0.75□□□□□ -2.29
TAF9Q05027 GEA2YEL022W 4380 nt0.75□□□□□ -2.29
TAF9Q05027 SWF1YDR126W 1011 nt0.74□□□□□ -2.29
TAF9Q05027 YIR044CYIR044C 186 nt0.74□□□□□ -2.29
TAF9Q05027 YOR072W-AYOR072W-A 249 nt0.74□□□□□ -2.29
TAF9Q05027 BUD3YCL014W 4911 nt0.73□□□□□ -2.29
TAF9Q05027 MAM33YIL070C 801 nt0.73□□□□□ -2.29
TAF9Q05027 RPL38YLR325C 237 nt0.72□□□□□ -2.29
TAF9Q05027 YML007C-AYML007C-A 111 nt0.72□□□□□ -2.29
TAF9Q05027 PRM3YPL192C 402 nt0.72□□□□□ -2.29
TAF9Q05027 CUL3YGR003W 2235 nt0.72□□□□□ -2.29
TAF9Q05027 YMR160WYMR160W 2451 nt0.71□□□□□ -2.3
TAF9Q05027 ISD11YER048W-A 285 nt0.71□□□□□ -2.3
TAF9Q05027 YJR011CYJR011C 786 nt0.71□□□□□ -2.3
TAF9Q05027 YJR157WYJR157W 363 nt0.71□□□□□ -2.3
TAF9Q05027 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt0.71□□□□□ -2.3
TAF9Q05027 YPR002C-AYPR002C-A 198 nt0.7□□□□□ -2.3
TAF9Q05027 PRP16YKR086W 3216 nt0.7□□□□□ -2.3
TAF9Q05027 DBP6YNR038W 1890 nt0.69□□□□□ -2.3
TAF9Q05027 YLL007CYLL007C 1998 nt0.69□□□□□ -2.3
TAF9Q05027 ALG13YGL047W 609 nt0.69□□□□□ -2.3
TAF9Q05027 IES4YOR189W 351 nt0.69□□□□□ -2.3
TAF9Q05027 YBR064WYBR064W 429 nt0.68□□□□□ -2.3
TAF9Q05027 BFR2YDR299W 1605 nt0.67□□□□□ -2.3
TAF9Q05027 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt0.67□□□□□ -2.3
TAF9Q05027 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt0.67□□□□□ -2.3
TAF9Q05027 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt0.67□□□□□ -2.3
TAF9Q05027 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt0.67□□□□□ -2.3
TAF9Q05027 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt0.67□□□□□ -2.3
TAF9Q05027 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt0.67□□□□□ -2.3
TAF9Q05027 YDR426CYDR426C 378 nt0.67□□□□□ -2.3
TAF9Q05027 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt0.67□□□□□ -2.3
TAF9Q05027 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt0.67□□□□□ -2.3
TAF9Q05027 YER079WYER079W 633 nt0.67□□□□□ -2.3
TAF9Q05027 AGA2YGL032C 264 nt0.67□□□□□ -2.3
TAF9Q05027 YNL324WYNL324W 396 nt0.67□□□□□ -2.3
TAF9Q05027 YBR206WYBR206W 324 nt0.67□□□□□ -2.3
TAF9Q05027 YDR344CYDR344C 444 nt0.66□□□□□ -2.3
TAF9Q05027 UTP20YBL004W 7482 nt0.65□□□□□ -2.3
TAF9Q05027 YOR282WYOR282W 321 nt0.65□□□□□ -2.31
TAF9Q05027 PCC1YKR095W-A 267 nt0.64□□□□□ -2.31
TAF9Q05027 YLR264C-AYLR264C-A 117 nt0.64□□□□□ -2.31
TAF9Q05027 YBR285WYBR285W 435 nt0.64□□□□□ -2.31
TAF9Q05027 PTP2YOR208W 2253 nt0.63□□□□□ -2.31
TAF9Q05027 YCK3YER123W 1575 nt0.63□□□□□ -2.31
TAF9Q05027 PMP1YCR024C-A 123 nt0.63□□□□□ -2.31
TAF9Q05027 OLI1Q0130 231 nt0.63□□□□□ -2.31
TAF9Q05027 YMR272W-AYMR272W-A 114 nt0.63□□□□□ -2.31
TAF9Q05027 NOP9YJL010C 2001 nt0.63□□□□□ -2.31
TAF9Q05027 MCM10YIL150C 1716 nt0.63□□□□□ -2.31
TAF9Q05027 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt0.62□□□□□ -2.31
TAF9Q05027 BSC3YLR465C 309 nt0.62□□□□□ -2.31
TAF9Q05027 YPL044CYPL044C 549 nt0.62□□□□□ -2.31
TAF9Q05027 YER137W-AYER137W-A 306 nt0.61□□□□□ -2.31
TAF9Q05027 Q0144Q0144 330 nt0.61□□□□□ -2.31
TAF9Q05027 QCR9YGR183C 201 nt0.61□□□□□ -2.31
TAF9Q05027 YHR138CYHR138C 345 nt0.61□□□□□ -2.31
TAF9Q05027 YOR053WYOR053W 342 nt0.61□□□□□ -2.31
TAF9Q05027 CSN9YDR179C 489 nt0.6□□□□□ -2.31
TAF9Q05027 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.6□□□□□ -2.31
TAF9Q05027 PAU12YGR294W 363 nt0.59□□□□□ -2.31
TAF9Q05027 VPS20YMR077C 666 nt0.59□□□□□ -2.31
TAF9Q05027 ECM12YHR021W-A 456 nt0.58□□□□□ -2.32
TAF9Q05027 LEE1YPL054W 906 nt0.58□□□□□ -2.32
TAF9Q05027 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.58□□□□□ -2.32
TAF9Q05027 CHS6YJL099W 2241 nt0.58□□□□□ -2.32
TAF9Q05027 LTE1YAL024C 4308 nt0.58□□□□□ -2.32
TAF9Q05027 ASE1YOR058C 2658 nt0.57□□□□□ -2.32
TAF9Q05027 YMR001C-AYMR001C-A 231 nt0.57□□□□□ -2.32
TAF9Q05027 YOR121CYOR121C 306 nt0.57□□□□□ -2.32
TAF9Q05027 YOR218CYOR218C 420 nt0.57□□□□□ -2.32
TAF9Q05027 YLR334CYLR334C 381 nt0.56□□□□□ -2.32
TAF9Q05027 NPR2YEL062W 1848 nt0.56□□□□□ -2.32
TAF9Q05027 YKL145W-AYKL145W-A 93 nt0.55□□□□□ -2.32
TAF9Q05027 HMRA2YCR096C 360 nt0.54□□□□□ -2.32
TAF9Q05027 YFR012W-AYFR012W-A 87 nt0.54□□□□□ -2.32
TAF9Q05027 YAR029WYAR029W 225 nt0.54□□□□□ -2.32
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