Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
SSBP1Q04837 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SSBP1Q04837 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms