Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ATP7AQ04656 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ATP7AQ04656 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ATP7AQ04656 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ATP7AQ04656 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ATP7AQ04656 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ATP7AQ04656 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ATP7AQ04656 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
ATP7AQ04656 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ATP7AQ04656 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ATP7AQ04656 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ATP7AQ04656 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC30.01■■■□□ 2.39
ATP7AQ04656 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC30.01■■■□□ 2.39
ATP7AQ04656 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ATP7AQ04656 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ATP7AQ04656 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
ATP7AQ04656 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ATP7AQ04656 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
ATP7AQ04656 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
ATP7AQ04656 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ATP7AQ04656 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ATP7AQ04656 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ATP7AQ04656 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ATP7AQ04656 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ATP7AQ04656 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ATP7AQ04656 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ATP7AQ04656 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ATP7AQ04656 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ATP7AQ04656 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC30■■■□□ 2.39
ATP7AQ04656 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
ATP7AQ04656 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ATP7AQ04656 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ATP7AQ04656 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ATP7AQ04656 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ATP7AQ04656 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
ATP7AQ04656 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ATP7AQ04656 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ATP7AQ04656 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ATP7AQ04656 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ATP7AQ04656 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ATP7AQ04656 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ATP7AQ04656 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
ATP7AQ04656 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
ATP7AQ04656 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ATP7AQ04656 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
ATP7AQ04656 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ATP7AQ04656 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ATP7AQ04656 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ATP7AQ04656 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
ATP7AQ04656 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
ATP7AQ04656 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ATP7AQ04656 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ATP7AQ04656 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ATP7AQ04656 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ATP7AQ04656 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ATP7AQ04656 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
ATP7AQ04656 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ATP7AQ04656 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ATP7AQ04656 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ATP7AQ04656 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ATP7AQ04656 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ATP7AQ04656 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ATP7AQ04656 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
ATP7AQ04656 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
ATP7AQ04656 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
ATP7AQ04656 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ATP7AQ04656 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ATP7AQ04656 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ATP7AQ04656 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
ATP7AQ04656 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ATP7AQ04656 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ATP7AQ04656 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ATP7AQ04656 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ATP7AQ04656 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ATP7AQ04656 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ATP7AQ04656 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ATP7AQ04656 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ATP7AQ04656 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ATP7AQ04656 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ATP7AQ04656 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ATP7AQ04656 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ATP7AQ04656 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ATP7AQ04656 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ATP7AQ04656 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ATP7AQ04656 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ATP7AQ04656 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ATP7AQ04656 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC29.96■■■□□ 2.39
ATP7AQ04656 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ATP7AQ04656 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
ATP7AQ04656 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
ATP7AQ04656 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
ATP7AQ04656 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
ATP7AQ04656 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
ATP7AQ04656 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
ATP7AQ04656 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
ATP7AQ04656 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
ATP7AQ04656 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
ATP7AQ04656 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
ATP7AQ04656 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
ATP7AQ04656 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms