Protein–RNA interactions for Protein: Q04048

SYF1, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SYF1Q04048 YOL160WYOL160W 342 nt1.4□□□□□ -2.19
SYF1Q04048 ROM2YLR371W 4071 nt1.4□□□□□ -2.19
SYF1Q04048 NUP145YGL092W 3954 nt1.4□□□□□ -2.19
SYF1Q04048 MPT5YGL178W 2580 nt1.39□□□□□ -2.19
SYF1Q04048 NPC2YDL046W 522 nt1.39□□□□□ -2.19
SYF1Q04048 YHR007C-AYHR007C-A 216 nt1.39□□□□□ -2.19
SYF1Q04048 INA22YIR024C 651 nt1.39□□□□□ -2.19
SYF1Q04048 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt1.39□□□□□ -2.19
SYF1Q04048 YPR063CYPR063C 423 nt1.39□□□□□ -2.19
SYF1Q04048 OST1YJL002C 1431 nt1.39□□□□□ -2.19
SYF1Q04048 AIM44YPL158C 2277 nt1.38□□□□□ -2.19
SYF1Q04048 AHC1YOR023C 1701 nt1.38□□□□□ -2.19
SYF1Q04048 YDR102CYDR102C 333 nt1.38□□□□□ -2.19
SYF1Q04048 SLI15YBR156C 2097 nt1.38□□□□□ -2.19
SYF1Q04048 NUP188YML103C 4968 nt1.37□□□□□ -2.19
SYF1Q04048 YKL118WYKL118W 312 nt1.37□□□□□ -2.19
SYF1Q04048 YLL020CYLL020C 306 nt1.37□□□□□ -2.19
SYF1Q04048 TAR1YLR154W-C 375 nt1.37□□□□□ -2.19
SYF1Q04048 RPL33BYOR234C 324 nt1.37□□□□□ -2.19
SYF1Q04048 YPL225WYPL225W 441 nt1.37□□□□□ -2.19
SYF1Q04048 YAR029WYAR029W 225 nt1.36□□□□□ -2.19
SYF1Q04048 APL3YBL037W 3078 nt1.36□□□□□ -2.19
SYF1Q04048 snR14snR14 160 nt1.36□□□□□ -2.19
SYF1Q04048 snR36snR36 182 nt1.36□□□□□ -2.19
SYF1Q04048 UBP3YER151C 2739 nt1.36□□□□□ -2.19
SYF1Q04048 PBY1YBR094W 2262 nt1.36□□□□□ -2.19
SYF1Q04048 YDR048CYDR048C 315 nt1.35□□□□□ -2.19
SYF1Q04048 YIL020C-AYIL020C-A 339 nt1.34□□□□□ -2.19
SYF1Q04048 MMS4YBR098W 2076 nt1.34□□□□□ -2.19
SYF1Q04048 LCD1YDR499W 2244 nt1.34□□□□□ -2.2
SYF1Q04048 CDC36YDL165W 576 nt1.33□□□□□ -2.2
SYF1Q04048 YJR011CYJR011C 786 nt1.33□□□□□ -2.2
SYF1Q04048 RAD34YDR314C 2079 nt1.33□□□□□ -2.2
SYF1Q04048 QCR9YGR183C 201 nt1.32□□□□□ -2.2
SYF1Q04048 MAM33YIL070C 801 nt1.32□□□□□ -2.2
SYF1Q04048 YIR044CYIR044C 186 nt1.32□□□□□ -2.2
SYF1Q04048 CUL3YGR003W 2235 nt1.32□□□□□ -2.2
SYF1Q04048 YDR413CYDR413C 576 nt1.31□□□□□ -2.2
SYF1Q04048 EAF1YDR359C 2949 nt1.3□□□□□ -2.2
SYF1Q04048 YPR117WYPR117W 7470 nt1.3□□□□□ -2.2
SYF1Q04048 NHP2YDL208W 471 nt1.3□□□□□ -2.2
SYF1Q04048 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt1.3□□□□□ -2.2
SYF1Q04048 YFL032WYFL032W 321 nt1.3□□□□□ -2.2
SYF1Q04048 PAN2YGL094C 3348 nt1.3□□□□□ -2.2
SYF1Q04048 SET3YKR029C 2256 nt1.29□□□□□ -2.2
SYF1Q04048 SPT7YBR081C 3999 nt1.29□□□□□ -2.2
SYF1Q04048 IFH1YLR223C 3258 nt1.29□□□□□ -2.2
SYF1Q04048 NST1YNL091W 3723 nt1.29□□□□□ -2.2
SYF1Q04048 YGL149WYGL149W 306 nt1.29□□□□□ -2.2
SYF1Q04048 RAD9YDR217C 3930 nt1.29□□□□□ -2.2
SYF1Q04048 PKH2YOL100W 3246 nt1.29□□□□□ -2.2
SYF1Q04048 STB6YKL072W 2301 nt1.29□□□□□ -2.2
SYF1Q04048 NIP100YPL174C 2607 nt1.28□□□□□ -2.2
SYF1Q04048 RPL39YJL189W 156 nt1.28□□□□□ -2.2
SYF1Q04048 PDE2YOR360C 1581 nt1.28□□□□□ -2.2
SYF1Q04048 PTP2YOR208W 2253 nt1.27□□□□□ -2.21
SYF1Q04048 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt1.27□□□□□ -2.21
SYF1Q04048 CDC39YCR093W 6327 nt1.26□□□□□ -2.21
SYF1Q04048 GPG1YGL121C 381 nt1.26□□□□□ -2.21
SYF1Q04048 RPL34BYIL052C 366 nt1.26□□□□□ -2.21
SYF1Q04048 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt1.26□□□□□ -2.21
SYF1Q04048 FIG4YNL325C 2640 nt1.26□□□□□ -2.21
SYF1Q04048 UTP20YBL004W 7482 nt1.26□□□□□ -2.21
SYF1Q04048 DBP6YNR038W 1890 nt1.25□□□□□ -2.21
SYF1Q04048 HTL1YCR020W-B 237 nt1.25□□□□□ -2.21
SYF1Q04048 YER097WYER097W 330 nt1.25□□□□□ -2.21
SYF1Q04048 NUP157YER105C 4176 nt1.25□□□□□ -2.21
SYF1Q04048 YCK3YER123W 1575 nt1.25□□□□□ -2.21
SYF1Q04048 YLL007CYLL007C 1998 nt1.25□□□□□ -2.21
SYF1Q04048 HMRA2YCR096C 360 nt1.24□□□□□ -2.21
SYF1Q04048 tF(GAA)BtF(GAA)B 73 nt1.24□□□□□ -2.21
SYF1Q04048 tF(GAA)FtF(GAA)F 73 nt1.24□□□□□ -2.21
SYF1Q04048 tF(GAA)GtF(GAA)G 73 nt1.24□□□□□ -2.21
SYF1Q04048 tF(GAA)H1tF(GAA)H1 73 nt1.24□□□□□ -2.21
SYF1Q04048 tF(GAA)H2tF(GAA)H2 73 nt1.24□□□□□ -2.21
SYF1Q04048 tF(GAA)MtF(GAA)M 73 nt1.24□□□□□ -2.21
SYF1Q04048 tF(GAA)P1tF(GAA)P1 73 nt1.24□□□□□ -2.21
SYF1Q04048 tF(GAA)P2tF(GAA)P2 73 nt1.24□□□□□ -2.21
SYF1Q04048 PAM16YJL104W 450 nt1.24□□□□□ -2.21
SYF1Q04048 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt1.24□□□□□ -2.21
SYF1Q04048 STO1YMR125W 2586 nt1.24□□□□□ -2.21
SYF1Q04048 YFL063WYFL063W 456 nt1.23□□□□□ -2.21
SYF1Q04048 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt1.23□□□□□ -2.21
SYF1Q04048 STE5YDR103W 2754 nt1.23□□□□□ -2.21
SYF1Q04048 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt1.22□□□□□ -2.21
SYF1Q04048 YDL206WYDL206W 2289 nt1.22□□□□□ -2.21
SYF1Q04048 SLD3YGL113W 2007 nt1.22□□□□□ -2.21
SYF1Q04048 YIL032CYIL032C 357 nt1.21□□□□□ -2.22
SYF1Q04048 YNL146WYNL146W 303 nt1.21□□□□□ -2.22
SYF1Q04048 SMC1YFL008W 3678 nt1.2□□□□□ -2.22
SYF1Q04048 MDS3YGL197W 4464 nt1.19□□□□□ -2.22
SYF1Q04048 DOP1YDR141C 5097 nt1.19□□□□□ -2.22
SYF1Q04048 snR60snR60 104 nt1.19□□□□□ -2.22
SYF1Q04048 SSS1YDR086C 243 nt1.19□□□□□ -2.22
SYF1Q04048 YIL142C-AYIL142C-A 333 nt1.19□□□□□ -2.22
SYF1Q04048 ALG13YGL047W 609 nt1.18□□□□□ -2.22
SYF1Q04048 YHL042WYHL042W 453 nt1.18□□□□□ -2.22
SYF1Q04048 APL1YJR005W 2103 nt1.17□□□□□ -2.22
SYF1Q04048 RPS25BYLR333C 327 nt1.16□□□□□ -2.22
SYF1Q04048 YDR521WYDR521W 336 nt1.15□□□□□ -2.23
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