Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CENPCQ03188 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CENPCQ03188 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CENPCQ03188 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CENPCQ03188 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CENPCQ03188 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CENPCQ03188 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CENPCQ03188 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CENPCQ03188 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CENPCQ03188 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CENPCQ03188 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CENPCQ03188 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CENPCQ03188 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CENPCQ03188 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CENPCQ03188 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CENPCQ03188 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CENPCQ03188 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CENPCQ03188 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPCQ03188 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPCQ03188 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPCQ03188 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPCQ03188 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CENPCQ03188 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPCQ03188 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPCQ03188 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CENPCQ03188 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPCQ03188 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CENPCQ03188 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CENPCQ03188 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPCQ03188 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPCQ03188 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPCQ03188 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CENPCQ03188 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPCQ03188 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CENPCQ03188 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPCQ03188 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CENPCQ03188 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPCQ03188 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPCQ03188 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPCQ03188 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPCQ03188 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CENPCQ03188 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CENPCQ03188 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CENPCQ03188 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CENPCQ03188 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CENPCQ03188 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CENPCQ03188 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CENPCQ03188 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CENPCQ03188 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPCQ03188 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPCQ03188 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPCQ03188 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPCQ03188 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPCQ03188 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CENPCQ03188 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CENPCQ03188 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CENPCQ03188 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CENPCQ03188 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CENPCQ03188 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CENPCQ03188 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CENPCQ03188 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CENPCQ03188 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CENPCQ03188 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CENPCQ03188 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CENPCQ03188 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CENPCQ03188 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CENPCQ03188 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CENPCQ03188 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CENPCQ03188 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CENPCQ03188 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CENPCQ03188 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms