Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
DSC2Q02487 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
DSC2Q02487 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms