Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
BNC1Q01954 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.95■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
BNC1Q01954 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms