Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CDR2Q01850 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CDR2Q01850 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms