Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
EXOSC10Q01780 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
EXOSC10Q01780 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
EXOSC10Q01780 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
EXOSC10Q01780 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
EXOSC10Q01780 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
EXOSC10Q01780 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXOSC10Q01780 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXOSC10Q01780 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXOSC10Q01780 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXOSC10Q01780 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXOSC10Q01780 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
EXOSC10Q01780 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXOSC10Q01780 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXOSC10Q01780 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXOSC10Q01780 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXOSC10Q01780 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXOSC10Q01780 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXOSC10Q01780 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXOSC10Q01780 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXOSC10Q01780 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXOSC10Q01780 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXOSC10Q01780 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXOSC10Q01780 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
EXOSC10Q01780 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EXOSC10Q01780 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EXOSC10Q01780 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EXOSC10Q01780 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EXOSC10Q01780 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EXOSC10Q01780 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EXOSC10Q01780 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EXOSC10Q01780 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EXOSC10Q01780 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EXOSC10Q01780 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EXOSC10Q01780 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EXOSC10Q01780 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EXOSC10Q01780 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EXOSC10Q01780 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
EXOSC10Q01780 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EXOSC10Q01780 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
EXOSC10Q01780 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EXOSC10Q01780 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EXOSC10Q01780 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EXOSC10Q01780 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EXOSC10Q01780 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EXOSC10Q01780 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EXOSC10Q01780 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EXOSC10Q01780 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EXOSC10Q01780 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EXOSC10Q01780 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EXOSC10Q01780 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EXOSC10Q01780 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EXOSC10Q01780 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EXOSC10Q01780 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EXOSC10Q01780 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
EXOSC10Q01780 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EXOSC10Q01780 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
EXOSC10Q01780 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EXOSC10Q01780 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EXOSC10Q01780 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EXOSC10Q01780 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
EXOSC10Q01780 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EXOSC10Q01780 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EXOSC10Q01780 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EXOSC10Q01780 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EXOSC10Q01780 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
EXOSC10Q01780 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EXOSC10Q01780 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
EXOSC10Q01780 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
EXOSC10Q01780 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EXOSC10Q01780 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
EXOSC10Q01780 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms