Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CACNA1DQ01668 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CACNA1DQ01668 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47 ms