Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
DEFA6Q01524 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms