Protein–RNA interactions for Protein: Q01064

PDE1B, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1BQ01064 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
PDE1BQ01064 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PDE1BQ01064 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms