Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
HSF1Q00613 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms