Protein–RNA interactions for Protein: Q00537

CDK17, Cyclin-dependent kinase 17, humanhuman

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK17Q00537 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CDK17Q00537 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CDK17Q00537 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms