Protein–RNA interactions for Protein: Q00535

CDK5, Cyclin-dependent-like kinase 5, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5Q00535 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CDK5Q00535 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CDK5Q00535 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms