Protein–RNA interactions for Protein: Q00534

CDK6, Cyclin-dependent kinase 6, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK6Q00534 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CDK6Q00534 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms