Protein–RNA interactions for Protein: P81877

SSBP2, Single-stranded DNA-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP2P81877 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SSBP2P81877 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms