Protein–RNA interactions for Protein: P62330

ARF6, ADP-ribosylation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF6P62330 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ARF6P62330 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ARF6P62330 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ARF6P62330 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF6P62330 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF6P62330 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF6P62330 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF6P62330 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF6P62330 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF6P62330 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF6P62330 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF6P62330 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF6P62330 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF6P62330 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF6P62330 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF6P62330 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF6P62330 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF6P62330 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF6P62330 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF6P62330 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF6P62330 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF6P62330 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF6P62330 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF6P62330 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF6P62330 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF6P62330 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF6P62330 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF6P62330 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF6P62330 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ARF6P62330 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF6P62330 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF6P62330 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF6P62330 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF6P62330 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF6P62330 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF6P62330 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF6P62330 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF6P62330 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF6P62330 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF6P62330 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF6P62330 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF6P62330 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF6P62330 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF6P62330 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF6P62330 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF6P62330 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF6P62330 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF6P62330 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF6P62330 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF6P62330 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF6P62330 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF6P62330 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF6P62330 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF6P62330 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF6P62330 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF6P62330 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ARF6P62330 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARF6P62330 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARF6P62330 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARF6P62330 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARF6P62330 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARF6P62330 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARF6P62330 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARF6P62330 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARF6P62330 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARF6P62330 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARF6P62330 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARF6P62330 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARF6P62330 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARF6P62330 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ARF6P62330 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARF6P62330 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARF6P62330 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARF6P62330 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARF6P62330 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARF6P62330 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ARF6P62330 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARF6P62330 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARF6P62330 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARF6P62330 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARF6P62330 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARF6P62330 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARF6P62330 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARF6P62330 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARF6P62330 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARF6P62330 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARF6P62330 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARF6P62330 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ARF6P62330 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARF6P62330 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARF6P62330 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARF6P62330 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
ARF6P62330 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARF6P62330 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARF6P62330 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARF6P62330 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARF6P62330 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARF6P62330 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARF6P62330 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ARF6P62330 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms