Protein–RNA interactions for Protein: P61088

UBE2N, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2NP61088 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
UBE2NP61088 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms