Protein–RNA interactions for Protein: P60606

CTXN1, Cortexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 82 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN1P60606 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTXN1P60606 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms