Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
ERVPABLB-1P60509 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms