Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
FAM3BP58499 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms