Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN15P56746 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN15P56746 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN15P56746 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN15P56746 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN15P56746 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN15P56746 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN15P56746 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN15P56746 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN15P56746 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CLDN15P56746 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN15P56746 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN15P56746 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN15P56746 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN15P56746 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN15P56746 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN15P56746 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN15P56746 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN15P56746 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN15P56746 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN15P56746 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN15P56746 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN15P56746 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN15P56746 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN15P56746 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN15P56746 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN15P56746 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN15P56746 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN15P56746 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN15P56746 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CLDN15P56746 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN15P56746 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN15P56746 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN15P56746 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN15P56746 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN15P56746 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN15P56746 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN15P56746 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN15P56746 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN15P56746 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN15P56746 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN15P56746 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN15P56746 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN15P56746 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN15P56746 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN15P56746 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN15P56746 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN15P56746 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN15P56746 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CLDN15P56746 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLDN15P56746 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
CLDN15P56746 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLDN15P56746 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLDN15P56746 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLDN15P56746 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLDN15P56746 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLDN15P56746 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CLDN15P56746 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN15P56746 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN15P56746 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN15P56746 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN15P56746 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN15P56746 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN15P56746 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN15P56746 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN15P56746 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN15P56746 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN15P56746 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN15P56746 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN15P56746 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN15P56746 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN15P56746 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN15P56746 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN15P56746 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN15P56746 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CLDN15P56746 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN15P56746 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN15P56746 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN15P56746 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN15P56746 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN15P56746 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN15P56746 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN15P56746 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN15P56746 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN15P56746 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN15P56746 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN15P56746 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN15P56746 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN15P56746 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN15P56746 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CLDN15P56746 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN15P56746 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN15P56746 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN15P56746 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CLDN15P56746 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN15P56746 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN15P56746 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN15P56746 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN15P56746 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CLDN15P56746 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms