Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AFDNP55196 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AFDNP55196 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AFDNP55196 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
AFDNP55196 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
AFDNP55196 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AFDNP55196 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
AFDNP55196 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
AFDNP55196 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
AFDNP55196 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
AFDNP55196 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AFDNP55196 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
AFDNP55196 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AFDNP55196 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
AFDNP55196 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
AFDNP55196 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
AFDNP55196 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
AFDNP55196 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AFDNP55196 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
AFDNP55196 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
AFDNP55196 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
AFDNP55196 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AFDNP55196 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
AFDNP55196 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AFDNP55196 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AFDNP55196 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AFDNP55196 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
AFDNP55196 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
AFDNP55196 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
AFDNP55196 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
AFDNP55196 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AFDNP55196 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AFDNP55196 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AFDNP55196 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AFDNP55196 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AFDNP55196 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AFDNP55196 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AFDNP55196 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
AFDNP55196 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AFDNP55196 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AFDNP55196 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AFDNP55196 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AFDNP55196 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AFDNP55196 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AFDNP55196 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AFDNP55196 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AFDNP55196 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AFDNP55196 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AFDNP55196 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AFDNP55196 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AFDNP55196 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AFDNP55196 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AFDNP55196 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
AFDNP55196 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
AFDNP55196 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
AFDNP55196 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
AFDNP55196 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AFDNP55196 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AFDNP55196 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AFDNP55196 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
AFDNP55196 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
AFDNP55196 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
AFDNP55196 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
AFDNP55196 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
AFDNP55196 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
AFDNP55196 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AFDNP55196 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AFDNP55196 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
AFDNP55196 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
AFDNP55196 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
AFDNP55196 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
AFDNP55196 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
AFDNP55196 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
AFDNP55196 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
AFDNP55196 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AFDNP55196 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AFDNP55196 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
AFDNP55196 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
AFDNP55196 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
AFDNP55196 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
AFDNP55196 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
AFDNP55196 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
AFDNP55196 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
AFDNP55196 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
AFDNP55196 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
AFDNP55196 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
AFDNP55196 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AFDNP55196 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AFDNP55196 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AFDNP55196 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AFDNP55196 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AFDNP55196 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
AFDNP55196 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
AFDNP55196 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AFDNP55196 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AFDNP55196 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
AFDNP55196 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AFDNP55196 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
AFDNP55196 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AFDNP55196 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms