Protein–RNA interactions for Protein: P54849

EMP1, Epithelial membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMP1P54849 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EMP1P54849 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
EMP1P54849 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EMP1P54849 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EMP1P54849 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EMP1P54849 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
EMP1P54849 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EMP1P54849 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
EMP1P54849 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
EMP1P54849 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EMP1P54849 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
EMP1P54849 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
EMP1P54849 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EMP1P54849 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
EMP1P54849 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
EMP1P54849 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EMP1P54849 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
EMP1P54849 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EMP1P54849 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EMP1P54849 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
EMP1P54849 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EMP1P54849 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
EMP1P54849 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
EMP1P54849 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EMP1P54849 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
EMP1P54849 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
EMP1P54849 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
EMP1P54849 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EMP1P54849 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
EMP1P54849 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EMP1P54849 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EMP1P54849 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EMP1P54849 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EMP1P54849 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
EMP1P54849 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EMP1P54849 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EMP1P54849 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EMP1P54849 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EMP1P54849 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EMP1P54849 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EMP1P54849 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EMP1P54849 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EMP1P54849 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EMP1P54849 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EMP1P54849 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EMP1P54849 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EMP1P54849 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EMP1P54849 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EMP1P54849 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
EMP1P54849 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EMP1P54849 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
EMP1P54849 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EMP1P54849 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EMP1P54849 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EMP1P54849 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EMP1P54849 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
EMP1P54849 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EMP1P54849 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EMP1P54849 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EMP1P54849 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EMP1P54849 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EMP1P54849 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EMP1P54849 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EMP1P54849 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
EMP1P54849 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
EMP1P54849 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EMP1P54849 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EMP1P54849 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EMP1P54849 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EMP1P54849 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EMP1P54849 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EMP1P54849 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EMP1P54849 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
EMP1P54849 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
EMP1P54849 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EMP1P54849 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EMP1P54849 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EMP1P54849 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
EMP1P54849 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EMP1P54849 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EMP1P54849 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EMP1P54849 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EMP1P54849 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EMP1P54849 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EMP1P54849 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EMP1P54849 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EMP1P54849 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EMP1P54849 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EMP1P54849 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EMP1P54849 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EMP1P54849 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EMP1P54849 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
EMP1P54849 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
EMP1P54849 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
EMP1P54849 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EMP1P54849 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EMP1P54849 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EMP1P54849 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EMP1P54849 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
EMP1P54849 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms