Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.58
RAD23AP54725 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
RAD23AP54725 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms