Protein–RNA interactions for Protein: P53396

ACLY, ATP-citrate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACLYP53396 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ACLYP53396 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ACLYP53396 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ACLYP53396 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACLYP53396 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACLYP53396 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACLYP53396 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACLYP53396 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ACLYP53396 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACLYP53396 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACLYP53396 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ACLYP53396 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACLYP53396 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACLYP53396 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACLYP53396 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACLYP53396 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACLYP53396 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ACLYP53396 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACLYP53396 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACLYP53396 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACLYP53396 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACLYP53396 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ACLYP53396 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACLYP53396 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACLYP53396 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACLYP53396 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACLYP53396 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ACLYP53396 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACLYP53396 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACLYP53396 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACLYP53396 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ACLYP53396 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACLYP53396 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACLYP53396 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACLYP53396 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACLYP53396 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACLYP53396 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACLYP53396 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACLYP53396 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACLYP53396 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACLYP53396 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACLYP53396 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ACLYP53396 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACLYP53396 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACLYP53396 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACLYP53396 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACLYP53396 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACLYP53396 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACLYP53396 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACLYP53396 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACLYP53396 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACLYP53396 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACLYP53396 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ACLYP53396 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACLYP53396 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACLYP53396 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACLYP53396 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACLYP53396 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ACLYP53396 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACLYP53396 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACLYP53396 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACLYP53396 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACLYP53396 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACLYP53396 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACLYP53396 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACLYP53396 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACLYP53396 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACLYP53396 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACLYP53396 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACLYP53396 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACLYP53396 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACLYP53396 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACLYP53396 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ACLYP53396 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACLYP53396 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACLYP53396 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACLYP53396 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACLYP53396 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACLYP53396 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ACLYP53396 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACLYP53396 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACLYP53396 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACLYP53396 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACLYP53396 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACLYP53396 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACLYP53396 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACLYP53396 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACLYP53396 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ACLYP53396 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACLYP53396 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ACLYP53396 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACLYP53396 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACLYP53396 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACLYP53396 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
ACLYP53396 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACLYP53396 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACLYP53396 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACLYP53396 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ACLYP53396 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ACLYP53396 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms