Protein–RNA interactions for Protein: P53367

ARFIP1, Arfaptin-1, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP1P53367 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ARFIP1P53367 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARFIP1P53367 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARFIP1P53367 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARFIP1P53367 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARFIP1P53367 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARFIP1P53367 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARFIP1P53367 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARFIP1P53367 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARFIP1P53367 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARFIP1P53367 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARFIP1P53367 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARFIP1P53367 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARFIP1P53367 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARFIP1P53367 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARFIP1P53367 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARFIP1P53367 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARFIP1P53367 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARFIP1P53367 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARFIP1P53367 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARFIP1P53367 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARFIP1P53367 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARFIP1P53367 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARFIP1P53367 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ARFIP1P53367 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ARFIP1P53367 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARFIP1P53367 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARFIP1P53367 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARFIP1P53367 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARFIP1P53367 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARFIP1P53367 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARFIP1P53367 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARFIP1P53367 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARFIP1P53367 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARFIP1P53367 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARFIP1P53367 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARFIP1P53367 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARFIP1P53367 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARFIP1P53367 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARFIP1P53367 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARFIP1P53367 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARFIP1P53367 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARFIP1P53367 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARFIP1P53367 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ARFIP1P53367 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARFIP1P53367 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARFIP1P53367 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARFIP1P53367 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARFIP1P53367 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARFIP1P53367 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARFIP1P53367 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARFIP1P53367 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARFIP1P53367 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARFIP1P53367 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARFIP1P53367 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARFIP1P53367 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARFIP1P53367 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARFIP1P53367 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARFIP1P53367 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARFIP1P53367 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARFIP1P53367 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARFIP1P53367 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARFIP1P53367 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARFIP1P53367 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARFIP1P53367 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARFIP1P53367 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARFIP1P53367 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARFIP1P53367 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARFIP1P53367 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARFIP1P53367 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARFIP1P53367 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARFIP1P53367 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARFIP1P53367 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ARFIP1P53367 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ARFIP1P53367 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ARFIP1P53367 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ARFIP1P53367 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ARFIP1P53367 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms