Protein–RNA interactions for Protein: P53333

CWC22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 577 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
CWC22P53333 YGR130CYGR130C 2451 nt1.11□□□□□ -2.23
CWC22P53333 KAP120YPL125W 3099 nt1.11□□□□□ -2.23
CWC22P53333 LCD1YDR499W 2244 nt1.11□□□□□ -2.23
CWC22P53333 COG4YPR105C 2586 nt1.1□□□□□ -2.23
CWC22P53333 GIM4YEL003W 336 nt1.1□□□□□ -2.23
CWC22P53333 PIP2YOR363C 2991 nt1.09□□□□□ -2.23
CWC22P53333 EMT1tM(CAU)D 73 nt1.09□□□□□ -2.23
CWC22P53333 EMT5tM(CAU)J1 73 nt1.09□□□□□ -2.23
CWC22P53333 EMT3tM(CAU)J2 73 nt1.09□□□□□ -2.23
CWC22P53333 EMT4tM(CAU)M 73 nt1.09□□□□□ -2.23
CWC22P53333 EMT2tM(CAU)O2 73 nt1.09□□□□□ -2.23
CWC22P53333 MAM33YIL070C 801 nt1.09□□□□□ -2.23
CWC22P53333 YAF9YNL107W 681 nt1.09□□□□□ -2.23
CWC22P53333 YBR221W-AYBR221W-A 105 nt1.09□□□□□ -2.23
CWC22P53333 BUD3YCL014W 4911 nt1.08□□□□□ -2.24
CWC22P53333 snR56snR56 88 nt1.08□□□□□ -2.24
CWC22P53333 tV(UAC)BtV(UAC)B 74 nt1.08□□□□□ -2.24
CWC22P53333 tV(UAC)DtV(UAC)D 74 nt1.08□□□□□ -2.24
CWC22P53333 YPL225WYPL225W 441 nt1.08□□□□□ -2.24
CWC22P53333 SLI15YBR156C 2097 nt1.08□□□□□ -2.24
CWC22P53333 RIM20YOR275C 1986 nt1.07□□□□□ -2.24
CWC22P53333 YOR029WYOR029W 336 nt1.07□□□□□ -2.24
CWC22P53333 YOR108C-AYOR108C-A 210 nt1.07□□□□□ -2.24
CWC22P53333 tR(ACG)Q2tR(ACG)Q2 74 nt1.06□□□□□ -2.24
CWC22P53333 BIL1YOR304C-A 231 nt1.06□□□□□ -2.24
CWC22P53333 YBR206WYBR206W 324 nt1.06□□□□□ -2.24
CWC22P53333 YJR029WYJR029W 5268 nt1.06□□□□□ -2.24
CWC22P53333 YPR137C-BYPR137C-B 5268 nt1.06□□□□□ -2.24
CWC22P53333 IML1YJR138W 4755 nt1.05□□□□□ -2.24
CWC22P53333 STO1YMR125W 2586 nt1.05□□□□□ -2.24
CWC22P53333 YDR102CYDR102C 333 nt1.05□□□□□ -2.24
CWC22P53333 YDR169C-AYDR169C-A 150 nt1.05□□□□□ -2.24
CWC22P53333 YDR521WYDR521W 336 nt1.05□□□□□ -2.24
CWC22P53333 YHR175W-AYHR175W-A 150 nt1.05□□□□□ -2.24
CWC22P53333 TTI1YKL033W 3117 nt1.04□□□□□ -2.24
CWC22P53333 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt1.04□□□□□ -2.24
CWC22P53333 HTB2YBL002W 396 nt1.04□□□□□ -2.24
CWC22P53333 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt1.04□□□□□ -2.24
CWC22P53333 YPR197CYPR197C 564 nt1.04□□□□□ -2.24
CWC22P53333 PCC1YKR095W-A 267 nt1.03□□□□□ -2.24
CWC22P53333 YAR029WYAR029W 225 nt1.03□□□□□ -2.24
CWC22P53333 FIG4YNL325C 2640 nt1.02□□□□□ -2.25
CWC22P53333 YDL073WYDL073W 2955 nt1.02□□□□□ -2.25
CWC22P53333 YDL206WYDL206W 2289 nt1.02□□□□□ -2.25
CWC22P53333 NUP145YGL092W 3954 nt1.02□□□□□ -2.25
CWC22P53333 HUG1YML058W-A 207 nt1.02□□□□□ -2.25
CWC22P53333 YBR064WYBR064W 429 nt1.02□□□□□ -2.25
CWC22P53333 NUP157YER105C 4176 nt1.02□□□□□ -2.25
CWC22P53333 PRP16YKR086W 3216 nt1.01□□□□□ -2.25
CWC22P53333 YCK3YER123W 1575 nt1.01□□□□□ -2.25
CWC22P53333 SMC1YFL008W 3678 nt1.01□□□□□ -2.25
CWC22P53333 YAR009CYAR009C 3591 nt1.01□□□□□ -2.25
CWC22P53333 PAN2YGL094C 3348 nt1□□□□□ -2.25
CWC22P53333 YDR048CYDR048C 315 nt1□□□□□ -2.25
CWC22P53333 SSS1YDR086C 243 nt1□□□□□ -2.25
CWC22P53333 YHL042WYHL042W 453 nt1□□□□□ -2.25
CWC22P53333 TAR1YLR154W-C 375 nt1□□□□□ -2.25
CWC22P53333 PDE2YOR360C 1581 nt1□□□□□ -2.25
CWC22P53333 PKH2YOL100W 3246 nt0.99□□□□□ -2.25
CWC22P53333 INA22YIR024C 651 nt0.99□□□□□ -2.25
CWC22P53333 YJL120WYJL120W 324 nt0.99□□□□□ -2.25
CWC22P53333 MYO1YHR023W 5787 nt0.98□□□□□ -2.25
CWC22P53333 YPR117WYPR117W 7470 nt0.98□□□□□ -2.25
CWC22P53333 MMS4YBR098W 2076 nt0.98□□□□□ -2.25
CWC22P53333 YDR344CYDR344C 444 nt0.98□□□□□ -2.25
CWC22P53333 STF2YGR008C 255 nt0.98□□□□□ -2.25
CWC22P53333 YIL115W-AYIL115W-A 372 nt0.98□□□□□ -2.25
CWC22P53333 UBP3YER151C 2739 nt0.98□□□□□ -2.25
CWC22P53333 OST1YJL002C 1431 nt0.98□□□□□ -2.25
CWC22P53333 GPG1YGL121C 381 nt0.97□□□□□ -2.25
CWC22P53333 YHL046W-AYHL046W-A 327 nt0.97□□□□□ -2.25
CWC22P53333 YPR159C-AYPR159C-A 102 nt0.97□□□□□ -2.25
CWC22P53333 SPO21YOL091W 1830 nt0.96□□□□□ -2.26
CWC22P53333 YLL007CYLL007C 1998 nt0.96□□□□□ -2.26
CWC22P53333 YDL240C-AYDL240C-A 138 nt0.96□□□□□ -2.26
CWC22P53333 YIR044CYIR044C 186 nt0.96□□□□□ -2.26
CWC22P53333 PAU24YBR301W 363 nt0.96□□□□□ -2.26
CWC22P53333 AIM44YPL158C 2277 nt0.96□□□□□ -2.26
CWC22P53333 YBR200W-AYBR200W-A 165 nt0.95□□□□□ -2.26
CWC22P53333 ASE1YOR058C 2658 nt0.95□□□□□ -2.26
CWC22P53333 CUL3YGR003W 2235 nt0.93□□□□□ -2.26
CWC22P53333 MCM10YIL150C 1716 nt0.93□□□□□ -2.26
CWC22P53333 NHP2YDL208W 471 nt0.93□□□□□ -2.26
CWC22P53333 YDR183C-AYDR183C-A 258 nt0.93□□□□□ -2.26
CWC22P53333 ATP6Q0085 780 nt0.93□□□□□ -2.26
CWC22P53333 YDL196WYDL196W 330 nt0.92□□□□□ -2.26
CWC22P53333 RPS25BYLR333C 327 nt0.92□□□□□ -2.26
CWC22P53333 RKR1YMR247C 4689 nt0.92□□□□□ -2.26
CWC22P53333 WAR1YML076C 2835 nt0.91□□□□□ -2.26
CWC22P53333 DBP6YNR038W 1890 nt0.9□□□□□ -2.26
CWC22P53333 HTL1YCR020W-B 237 nt0.9□□□□□ -2.27
CWC22P53333 YER097WYER097W 330 nt0.9□□□□□ -2.27
CWC22P53333 YFL063WYFL063W 456 nt0.9□□□□□ -2.27
CWC22P53333 snR36snR36 182 nt0.9□□□□□ -2.27
CWC22P53333 COG8YML071C 1824 nt0.89□□□□□ -2.27
CWC22P53333 GEA2YEL022W 4380 nt0.89□□□□□ -2.27
CWC22P53333 YFL032WYFL032W 321 nt0.89□□□□□ -2.27
CWC22P53333 YMR031W-AYMR031W-A 327 nt0.89□□□□□ -2.27
CWC22P53333 ECM12YHR021W-A 456 nt0.88□□□□□ -2.27
CWC22P53333 YOR011W-AYOR011W-A 207 nt0.88□□□□□ -2.27
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